Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
18
Wprowadzenie
Rysunek1.12.Dopasowywaniesekwencjilizozymuzbiałkajajakurzegoi0-laktoalbuminypawiana.(b)Superpozycjastrukturlizozymuzbiał-
kajajakurzegoi0-laktoalbuminypawiana
•komputeroweprzewidywaniestruktury:algorytmy
przewidywaniastrukturybiałekzsekwencjiamino-
kwasowejsąsolidneimiarodajne;
•wnioskowaniefunkcjinapodstawiepodobieństwa
sekwencjilubnawetpodobieństwastrukturyjuż
niejestażtakmiarodajne;nawetniewielkiezmia-
nywobrębiesekwencji,oddziałującewznikomym
stopniunacałkowitąstrukturę,mogąprowadzić
dozmianyfunkcji,zwłaszczawtedy,gdydanaresz-
tadotkniętazmianąwpływanamechanizmkata-
lityczny.
Rodzinybiałek
Jedenmechanizmewolucjibiałekpowodujeserięmu-
tacjiwposzczególnychobszarach.Wwieluprzypad-
kachzmianazaledwiewobrębiekilkuaminokwa-
sówprowadzidopewnychzaburzeń,alenieniszczy
całejstruktury.Dywergencjategorodzaju–zarówno
wobrębiejednegogatunku,poduplikacjigenów,lub
międzygatunkami–odpowiadazapowstanierodziny
pokrewnychbiałek.Rysunek1.12przedstawiadopa-
sowanesekwencjeinałożonestrukturypokrewnych
białek:lizozymuzbiałkajajakurzegoialfa-laktoal-
buminypawiana.Pomimopodobieństwanapoziomie
37%identycznychresztwdopasowanychsekwencjach,
strukturysądosiebiebardzopodobne.Zkoleifunk-
cjaulegazmianie:lizozymhydrolizujepolisacharydy
wścianachkomórkowychbakterii;alfa-laktoalbumi-
najestpodjednostkąregulatorowąodpowiedzialną
zasyntezęlaktozyorazsterowaniesynteząlaktozy
wmleku.
Dopasowaniesekwencjiisuperpozycjastruktury
stanowiąprzykładyfundamentalnychoperacjiprze-
prowadzanychwbioinformatyce.
