Treść książki
Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
Spistreści
VII
Metagenomika:pobraniegenomówzpróbekśrodowiskowych
Ludzkimikrobiom
Genomyeukariontów
Rodzinygenów
GenomSaccharomycescerevisiae(drożdżypiekarniczych)
GenomCaenorhabditiselegans
GenomDrosophilamelanogaster
GenomArabidopsisthaliana
GenomHomosapiens(genomczłowieka)
Genykodującebiałka
Sekwencjepowtarzalne
RNA
Polimorfizmypojedynczegonukleotyduihaplotypy
Systematycznepomiaryizbiorypolimorfizmówpojedynczegonukleotydu
Różnorodnośćgenetycznawantropologii
SekwencjeDNAajęzyki
Ewolucjagenomów
Proszęprzekażgeny:poziomytransfergenów
Genomikaporównawczaueukariontów
Polecanaliteratura
Ćwiczeniaizagadnieniaproblematyczne
4
Dopasowaniaidrzewafilogenetyczne
Wprowadzeniedodopasowaniasekwencji
Macierzpunktowaadopasowaniesekwencji
Miarypodobieństwasekwencji
Systemypunktacji
Pochodneodmacierzysubstytucji:macierzePAM
Obliczaniedopasowywaniadwóchsekwencji
Odmianyiuogólnienia
Metodyaproksymacjidlaszybkiejidentyfikacjibazdanych
Algorytmprogramowaniadynamicznegodlaoptymalnegodopasowania
dwóchsekwencji
Znaczeniedopasowań
Dopasowaniewielusekwencji
107
109
110
111
111
113
115
115
117
118
118
119
119
122
123
125
125
128
129
130
131
133
134
140
142
143
144
146
146
146
148
153
155
Zastosowaniedopasowaniawielusekwencjidoprzeszukiwaniabazdanych156
Profile
158
PSI-BLAST
160
CałkowitedopasowanieparsekwencjidlaludzkiegobiałkaPAX-6iDrosophilamelanogastere
yeless
164
UkrytemodeleMarkowa(HiddenMarkovModels,HMM)
165