Treść książki

Przejdź do opcji czytnikaPrzejdź do nawigacjiPrzejdź do informacjiPrzejdź do stopki
3.Komputerjakonarzędziepracychemika-
problemywprowadzaniadanych
Postęptechnologiczny,jakidokonałwostatnichdziesięcioleciach,doprowadził
dowzrostuliczbydostępnychdanych.Wymuszatokoniecznośćciągłegoposzu-
kiwaniacoraztowydajniejszychmetodichprzetwarzania,przechowywaniaoraz
wizualizacji.Jakkażdanauka,takżechemiastałasięnieprzebranymzbioremin-
formacji.Ichanaliza,awszczególnościpoprawnainterpretacjastanowiobecniepo-
ważnewyzwaniemetodologiczne,któremupoświęcasięwieleuwagi.Szczególnie
pomocnewefektywnymprzetwarzaniudanychchemicznychokazałosięzastoso-
wanietechnologiiialgorytmówinformatycznych.
Chemiatworzyspecyficzny-wporównaniuzinnymidyscyplinaminaukowy-
mi,wktórychwymianainformacjiopartajestgłównienadanychtekstowychlub
numerycznych-typdanych:cząsteczkęchemiczną,obojętneelektrycznie,trwale
połączoneindywiduumchemicznezłożonezwięcejniżjednegoatomu.
Ramka5
Cząsteczka(molekuła)-obojętneelektrycznieindywiduummolekularneobejmu-
jącewięcejniżjedenatom(n>1).Formalniecząsteczcemusiodpowiadaćminimumnapo-
wierzchnienergiipotencjalnejzconajmniejjednymstanemwibracyjnym.
Indywiduummolekularne(ang.molecularentity)-dowolnyatom,molekuła,jon,
parajonowa,rodnik,kompleks,konformeritp.wyróżniającysiękonstytucyjnielubizotopo-
wo-mającyprzytymcharakterodrębnejjednostki.
Odmianachemiczna(ang.chemicalspecies)-zbiórchemicznieidentycznychindy-
widuówmolekularnych,którywskaliczasowejeksperymentumożeprzyjmowaćwartości
ztegosamegozbiorupoziomówenergetycznych.Termintenstosujesięzarównowodnie-
sieniudochemicznieidentycznychjednostkowychukładówatomów,jakidocząsteczek.
Naprzykładdwaizomerykonformacyjne(konformery)mogąprzekształcaćsięwzajemnie
wsiebiewystarczającowolno,bymożnabyłotenefektzaobserwowaćprzezzróżnicowanie
ichwidmNMR.Wpomiarzetakimczęstotliwośćradiowaużytegoweksperymenciespek-
trometruwyznaczaskalęczasowąeksperymentu,októrejmowawdefinicji.Podczaswol-
nejreakcjitasamamieszaninakonformerówmożejednakzachowywaćsiętakjakodmiana
chemicznapojedynczegostanu,tzn.wzasadziewystępujetustanpełnejrównowagowejpo-
pulacjiowartościachprzyjmowanychwcałkowitymzbiorzepoziomówenergiicząsteczko-
wejcharakterystycznejdlaobukonformerów.Termin„odmianachemiczna”częstowykorzy-
stywanyjestdoopisuindywiduówmolekularnychzawierającychizotopy.Definicjaodmiany
chemicznejobejmujezarównoprzypadkigrafitu(alotropia),jakipowierzchniowejwarstwy
tlenku,tzn.zarównotakieprzypadki,dlaktórychistniejąpodstawowejednostkistrukturalne,
jakitakie,wktórychjednostkitakiemogąwogóleniewystępowaćwpostaciwyizolowanej.